Осуществляемые Обрнадзором РБ отдельные полномочия переданы Министерству образования и науки Республики Башкортостан. 

Указом Главы Республики Башкортостан от 13.10.2020 № УГ-439 «О мерах по совершенствованию структуры исполнительных органов государственной власти Республики Башкортостан» Обрнадзор РБ упразднен. Осуществляемые Обрнадзором РБ отдельные полномочия в соответствии с Федеральным законом от 29.12.2012 № 273-ФЗ «Об образовании в Российской Федерации» переданы Министерству образования и науки Республики Башкортостан.